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【干货】关于逆转录和RT-qPCR的优化全解析
人阅读 发布时间:2022-02-28 06:56
逆转录(Reverse Transcription)是以RNA为模板,在逆转录酶的催化作用下,合成RNA/DNA杂合双链,然后水解杂合双链中的RNA,得到互补的单链cDNA的过程。得到的cDNA单链可以作为扩增模板,合成双链DNA。cDNA的合成可以用于后续的PCR实验、qPCR实验、基因检测、基因工程等各个领域。
逆转录PCR(RT-PCR )是先从 RNA 反转录得到 cDNA,然后再用PCR进行定量分析,具有灵敏性高、操作简单等优点,广泛应用于如传染病细菌和病毒病原体检测、动物病原体检测、癌症标志物检测、食品安全监测等等。
不同的mRNA转录成cDNA的效率不同,适合某一种mRNA转录的条件可能对另一种mRNA不适合,因此,在进行不均一mRNA反转录时,下面的参数非常重要。
一般来说MMLV是最常用的逆转录酶,它分为野生型和突变型:
迈迪安提供的是MMLV 逆转录酶,包含野生型(MDX044 &043)和突变型(MDX042 &117)。其中MDX117是热稳定型MMLV, 耐受温度最高可达60度。
一般来说,Oligo dT (BIO-38029)因为其可获得mRNA的全长拷贝,应用范围广泛;如果mRNA长度过长>4kb,或者没有polyA尾(原核mRNA或rRNA),建议是选择使用随机引物 (BIO-38028);最后一个基因特异性引物适用于目的序列已知的情况,仅扩增特定cDNA片段,通常在一步RT-PCR法中使用。当前,Oligo-dT引物和随机引物的混合常是逆转录过程中最佳的选择。
一般来说,RT-qPCR用于诊断检测中最重要的两个指标是灵敏度和特异性,下文针对这两个方面的主要优化方法进行了汇总。
适当提高逆转录酶的用量可以提高逆转录的灵敏度,但是过量的逆转录酶也会对Taq聚合酶产生抑制作用。因此,在优化的时候,建议对逆转录酶的用量进行梯度测试,来选取反应需要的最优浓度。
迈迪安生物科技提供各种开发高灵敏、高特异的RT-qPCR检测所需的组分和优化的预混液配方,本文中所有提到的相关试剂整理如下,欢迎联系我们订购样品测试:
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